赤紫蘇のデータ駆動型育種（デジタル育種）

染色体レベルのゲノム配列情報の取得に成功

食卓を彩る身近な食材のひとつである「赤シソ」について、DNA解析技術を用いて、全ゲノム（約12億6000万塩基対）の約99%を染色体レベルの巨大な配列でカバーするゲノム配列情報を決定しました。

さらに、新たに開発した植物の遺伝子機能を予測するワークフロー「Fanflow4Plants」を用いて、タンパク質をコードする76,825遺伝子の約95%に相当する72,983遺伝子について、機能予測を行いました。

品種改良で重要になるゲノム配列情報

ゲノム配列や発現遺伝子を様々な条件下や品種間で比較することで、目的の特性を持つ品種を効率的に選抜することができます。そのためには、まず連続性の高いゲノム配列情報の取得が必要です。

プラチナバイオは、サンプルの抽出からゲノム解析まで豊富な経験を持っており、さまざまな生物のゲノム解析を実現していきます。

その後の展開：ゲノム編集で成分を変えたシソ

広島大学、三島食品、広島県立総合技術研究所の研究グループは、ゲノム編集（CRISPR-Cas9）でフラバノン 3-ヒドロキシラーゼ（F3H）の遺伝子を働かなくした赤シソの系統を作りました。葉が緑色になった系統が得られ、試験条件下で、抗酸化・抗炎症作用をもつルテオリンの含有量が、編集していない同じ品種の約 6 倍になった系統もありました。

この研究では、ここで決定したゲノム配列情報を、編集した遺伝子の位置の特定、遺伝子発現の解析、狙っていない場所に変異が入っていないかの確認に使っています（Matsushita et al., Front. Plant Sci., 2026）。

関連情報

• パートナー（ゲノム解読）: 三島食品 / 広島大学 / 国立遺伝学研究所 / 広島県立総合技術研究所 / プラチナバイオ
• ゲノム編集の研究グループ: 広島大学 / 三島食品 / 広島県立総合技術研究所
• 分野: フード＆アグリ、食資源の持続的調達、デジタル育種
• 広島大学プレスリリース（ゲノム解読）: https://www.hiroshima-u.ac.jp/news/74543
• 広島大学プレスリリース（ゲノム編集、2026-06-30）: https://www.hiroshima-u.ac.jp/news/98563
• 論文（ゲノム編集）: https://doi.org/10.3389/fpls.2026.1877946