赤紫蘇のデータ駆動型育種（デジタル育種）

染色体レベルのゲノム配列情報の取得に成功

食卓を彩る身近な食材のひとつである「赤シソ」について、DNA解析技術を用いて、全ゲノム（約12億6000万塩基対）の約99%を染色体レベルの巨大な配列でカバーするゲノム配列情報を決定しました。

さらに、新たに開発した植物の遺伝子機能を予測するワークフロー「Fanflow4Plants」を用いて、タンパク質をコードする76,825遺伝子の約95%に相当する72,983遺伝子について、機能予測を行いました。

品種改良で重要になるゲノム配列情報

ゲノム配列や発現遺伝子を様々な条件下や品種間で比較することで、目的の特性を持つ品種を効率的に選抜することができます。そのためには、まず連続性の高いゲノム配列情報の取得が必要です。

プラチナバイオは、サンプルの抽出からゲノム解析まで豊富な経験を持っており、さまざまな生物のゲノム解析を実現していきます。

関連情報

• パートナー: 三島食品 / 広島大学 / プラチナバイオ
• 分野: フード＆アグリ、食資源の持続的調達、デジタル育種
• 広島大学プレスリリース: https://www.hiroshima-u.ac.jp/news/74543